רוב הצעירים ב"בית קמפר" משתתפים בחוגים טיפוליים, בנוסף לטיפול הקונבנציונלי. בדומה לילדים בבית הילדים "הרי ירושלים", גם הנערים מקבלים טיפול נוסף באמצעות טיפולים אלטרנטיביים כדי לאפשר להם להתמודד עם רגשות קשים באופן אינטואיטיבי, לא מילולי, אשר יכול לסייע בשיקום שלהם. עבור הנערים ב"בית קמפר", חלק מהטיפולים מתקיימים מחוץ למעון ונותנים לנערים הזדמנות לנקוט בצעדים נוספים לקראת עצמאות ושילוב מחדש בחברה.